是什么让人类大脑与众不同? 一项发表在《细胞》杂志上的新研究鉴定出了两个与人类大脑特征相关的基因,并为发现更多此类基因提供了路线图。这项研究可能有助于深入了解人类大脑的功能和进化,以及语言障碍和自闭症的根源。
这两个新鉴定出的基因存在于人类基因组的“暗物质(dark matter)”区域:这些DNA区域包含大量之前一直难以研究的重复序列。
如果对DNA序列的组装就像把撕碎的页面拼成一本书,那么利用重复序列重建DNA就好比仅靠“and”和“the”这类词来匹配页面。错配和重叠的可能性极大。尽管研究困难,但DNA重复序列也被认为对进化很重要,因为它们可以产生现有基因的新版本供自然选择作用。
“从历史上看,这一直是个非常具有挑战性的问题。人们不知道从哪里开始,”论文通讯作者、加州大学戴维斯分校基因组中心基因组学副主任 Megan Dennis 说。
2022年,Dennis 是一篇描述首个完整人类基因组序列(称为‘端粒到端粒(telomere to telomere)’参考基因组)论文的合著者。该参考基因组包含了2001年发布的首个草案中遗漏的困难区域,现正被用于新的发现。
鉴定人类大脑基因
Dennis 及其同事们使用端粒到端粒人类基因组来识别重复基因(duplicated genes)。然后,他们根据千人基因组计划(1000 Genomes Project)的序列,筛选出那些:在大脑中表达、存在于所有人类中、且是保守的(conserved)(即它们在个体间没有表现出太大变异)的基因。
他们筛选出了大约250个候选基因家族。从中,他们挑选了一些在动物模型斑马鱼(zebrafish) 中进行进一步研究。通过剔除基因和将人类重复基因引入斑马鱼,他们证明其中至少有两个基因可能促成人类大脑特征:一个名为 GPR89B 的基因导致脑容量略微增大,另一个名为 FRMPD2B 的基因导致突触信号传导(synapse signaling)改变。
“想想你可以用斑马鱼来测试人类大脑特征,这很酷,” Dennis 说。Dennis 表示,这篇论文中的数据集旨在成为科学界的资源。例如,它应使筛查重复区域中与语言缺陷或自闭症相关的突变(这些突变在之前的全基因组筛选中被遗漏)变得更加容易。